Dal 2006 è nata una collaborazione con la Fondazione Memofonte di Firenze che si occupa dello studio per l’elaborazione informatica delle fonti storico-artistiche. Tale ambito di ricerca ha consentito di promuovere progetti comuni volti a valorizzare fonti documentarie prodotte da artisti e storici dell’arte del XIX e XX secolo, estendendo la cooperazione ad incontri e seminari sulle metodologie di analisi dei vari contesti studiati dalle due Istituzioni.

Dal 2005 il Vittoriale degli Italiani ha siglato una convenzione con il Laboratorio di Arti Visive per un progetto di ricerca consistente nella digitalizzazione dei fondi fotografici appartenuti a Henry Thode e a Gabriele d’Annunzio finalizzata alla loro catalogazione informatizzata e conseguente fruizione via web

I dipinti della Galleria Comunale d'Arte Moderna e Contemporanea di Roma sono stati oggetto di un'estesa campagna di analisi non invasive. I risultati delle indagini, in via di pubblicazione, sono in parte disponibili nella Banca Dati del Laboratorio di Arti Visive consultabile on line.

La collaborazione nata con il Gabinetto Disegni e Stampe degli Uffizi nel corso del 2004 ha permesso d'ampliare la tipologia di raccolte presenti nell' Archivio di Stampe di Traduzione grazie all'acquisizione fotografica di repertori di stampe sette-ottocenteschi che documentano collezioni principesche e private quali la raccolta di quadri posseduti dal granduca Pietro Leopoldo, i dipinti della Galleria di Dresda, le raccolte della Galleria degli Uffizi e di Palazzo Pitti, ma anche la raccolta dei Marchesi Gerini.

Nel 2006 è stata attivata una collaborazione biennale (rinnovata nel 2008 ed attualmente in corso) con il Museo Numismatico della Zecca dell'Istituto Poligrafico e Zecca dello Stato S.p.A., per la realizzazione congiunta di uno strumento informatico di studio e ricerca sulla medaglistica pontificia.

I dipinti del Museo Civico di Vicenza sono stati oggetto di un'ampia campagna di analisi non invasive. I risultati delle indagini sono stati pubblicati nei volumi del catalogo scientifico della pinacoteca, oltre che nella Banca Dati del Laboratorio di Arti Visive disponibile on line

Grazie alla collaborazione con la Biblioteca Universitaria di Pisa, a partire dal 2004 è stato possibile effettuare una serie di campagne fotografiche per l'acquisizione in formato digitale di alcuni importanti repertori di stampe quali l'Etruria Pittrice di Marco Lastri, la Storia dell'Arte di Leopoldo Cicognara e le Famiglie Celebri di Pompeo Litta.

Grazie alla collaborazione con l'Università degli Studi di Udine nata nel 2004, il Laboratorio di Arti Visive ha avviato due progetti di ricerca sul lessico dell'Informale di cui è responsabile scientifico Flavio Fergonzi e sulla Fototeca d'arte di Henry Thode e Gabriele d'Annunzio al Vittoriale degli Italiani. In particolare, quest'ultimo vede la partecipazione anche del LIDA (Laboratorio Informatico per la Documentazione storico Artistica) del Dipartimento di Storia e Tutela dei Beni Culturali, con cui il Laboratorio di Arti Visive ha siglato una convenzione.

Dal 2001 il Laboratorio di Arti Visive collabora con la Sezione Archeometria dell'Istituto di Fisica Generale Applicata dell'Università degli Studi di Milano per la realizzazione di analisi non invasive sulle opere d'arte. I risultati delle indagini sono stati inseriti nella Banca Dati del Laboratorio di Arti Visive disponibile on line.